Günümüzde temel ve biyolojik bilimlerdeki birçok araştırmanın disiplinlerarası bir şekilde ilerlediği görülmektedir; bununla birlikte araştırmacılar, çalışmalarının sonuçlarını iyileştirmek için çeşitli metotlardan faydalanmaktadır. Bu metotlar arasında biyomoleküllerin hücre içi ve hücre dışı fonksiyonlarının analizinde kullanılan çeşitli in silico analizler de bulunmaktadır. Biyomoleküllerin biyofiziksel modellemesi yapılabilen, enerji hesaplamalarıyla moleküllerin şekil ve fonksiyonlarına yönelik bilgi edinilebilen yöntemlerden olan Moleküler Dinamik (MD) simülasyonları, en iyi in silico örneklerden birini oluşturmaktadır.
