Moleküler Biyoloji, Gen Mühendisliği ve Biyoinformatik alanlarında oldukça sık kullanılan programlardan biri olan SnapGene programının kullanımı hakkında ön bilgiler paylaşılmıştır. Uygulamada tasarımların yapılması ve moleküler tekniklerin kullanılması hakkında da paylaşımlar devam edecektir.
Bioinforange platformu kurucusu.
Doktora öğrencisi, Sabancı Üniversitesi – SUNUM.
Biyoteknoloji, Gen Mühendisliği, Biyoinformatik.
Merhaba. Bir plazmite klonlama yaptıktan sonra gelen ham sekans verilerini nasıl değerlendiriyoruz ? Daha büyük bir alan okunuyor ve bazen klonlanan gen ters girebiliyor. Bu konuda bilgi verir misiniz?
Merhaba, sekans verilerinin analizini yine Snapgene programı veya Ugene gibi programlar kullanılarak yapıyorum. Sanger veya NextGeneration dizilime türüne göre analiz yaklaşımlarım değişiyor. Sanger analizlerinde ilk dizi okumaları problemli oluyor, Snapgene’de incelerken mesela grafikte piklere dikkat ederek okumanın doğru olup olmadığını anlayabiliyorum. Klonlanan genin plasmide ters yönlü klonlanması, stratejinizle ilgili olabilir. Yönlendirilmiş klonlama stratejilerini tercih etmeniz gerekebilir iki farklı restriksiyon enzim kesimi kullanarak veya farklı klonlama methodları var, buradan anlatımım oldukça uzun olacaktır ancak videolu olarak onlardan da bahsedeceğim.
Fon rengini nasıl değiştiriyoruz